Die ehemalige Abteikirche Saint Germain ist die älteste Kirche von
Auxerre. Sie wurde einem der ersten Bischöfe der Stadt, dem Heiligen Germanus, geweiht.
Der Heilige Germanus (St. Germain) genoss in ganz Frankreich eine beachtliche religiöse und politische Autorität. Nach seinem Tod ließ Chlothilde (die Frau des ersten christlichen Königs Chlodwig) über seinem Grab eine Basilika erbauen. Diese wurde später mehrmals umgebaut und erweitert. Sie behält jedoch bis heute einen enormen künstlerischen und historischen Wert.
Besonders bemerkenswert ist die Kryptenanlage der größte Bau der karolingischen Architektur in Frankreich.